珪藻は水域の水温，塩分濃度，酸性度などの環境要因に対応した種類が，各々の環境許容範囲の中で生息している。抽出された珪藻化石を分析することによって堆積物生成当時の水域の環境を復元することができ，淡水成層の判定もできる。