朝見川断層については、候補地付近の地質構成についての情報が不足していたため、事前にボーリング調査を行い、その結果をふまえてトレンチ調査の可否も含めて再度調査位置・方法を検討した。その結果、当初ボーリング調査を行った朝見川地区ではトレンチ掘削は困難と判断し、かわりに堀田地区でトレンチ調査を試みたが、断層を確認できなかったため、本格的な調査は断念した。

また、由布院断層については、由布院１地点での調査を先行させ、その結果をふまえて第２地点を具体化した。