調査地中央部では長さ約６００ｍの区間でほぼ連続してＦ４−２面とＦ４−３面に断層変位地形が認められる。また上流（南東）側から連続するＦ３−１面とＦ３−３面およびＦ４−１面が恵那山断層を境に下流（北西）側には分布せず、断層付近で急崖をなす。恵那山断層を横断するＦ４−４面とＦ５面およびＦ６面には断層変位地形は認められない。同断層による各地形面の鉛直変位量の詳細については地形測量や空中写真図化結果による地形解析の項目（３．３．２）で後述するが、概略の鉛直変位量はＦ３−１面で約１５ｍ、Ｆ４−１面で約５ｍ、Ｆ４−２面で２〜３ｍ、Ｆ４−３面で１〜２ｍである。

断層の隆起側の地形面が複数の地形面に分化し、断層の沈降側の地形面の一部が低位の地形面に埋積されることから、調査地中央部で恵那山断層はＦ３−１面の形成以降に繰り返し活動しているものと判断される。

調査地北東部ではＨ１’−１面に断層崖が認められる。恵那山断層を横断するＦ４−１面とＦ６面およびｄｔ面には断層変位地形は認められない。