畑野断層では，トレンチ候補地点として，市木地点，西入野地点，上野田地点の３地点を選定し，トレンチ位置の絞りこみのため，３地点でボーリング調査を行なった。

ボーリング調査は平成１１年９月〜１０月に実施し，平成１１年１０月２０日の第４回委員会に調査結果を報告し，トレンチ調査地点として市木地点が決定された。

寒川断層では，トレンチ候補地点として長田地点，大町地点の２地点を選定し，トレンチ位置の絞りこみのため，両地点でボーリング調査を実施した。ボーリング調査は，平成１１年９月〜１０月にボーリング調査を実施し，平成１１年１１月２５日の第５回委員会に調査結果を報告し，トレンチ調査地点として長田地点が決定された。

池田断層では，トレンチ候補地点として上石床東地点，平山地点の２地点を選定し，トレンチ位置の絞りこみのため，両地点でボーリング調査を行なった。ボーリング調査は平成１１年１１月に実施し，平成１１年１１月２５日の第５回委員会に調査結果を報告し，トレンチ調査地点として平山地点が決定された。

米湊断層では，反射法地震探査（伊予市宮下音地測線）で米湊断層の東方への延長が確認できなかった。このため，変位地形が明瞭な箇所で，完新世における米湊断層の活動度を解明することを目的としたボーリング調査を，伊予市尾崎地点で実施することが平成１１年１１月２５日の第５回委員会で決定された。ボーリング調査は平成１１年１２月に実施し，平成１１年１２月２１日の第６回委員会に報告した。